Para actualizar los paquetes de R a R 3.3.1 en jessie, simplemente añade a tu archivo de repositorios ( /etc/apt/sources.list) esta línea:

deb http://<favourite-cran-mirror>/bin/linux/debian jessie-cran3/

Sustituye <favourite-cran-mirror> por uno de los enlaces a los mirror de la lista.

Después ya puedes actualizar el sistema con el comando:

~$ sudo aptitude update
~$ sudo aptitude safe-upgrade

Si recibes un error parecido a este:

W: Error de GPG: http://cran.rediris.es jessie-cran3/ Release: Las firmas siguientes no se pudieron verificar porque su clave pública no está disponible: NO_PUBKEY 06F90DE5381BA480

Necesitas añadir la llave GPG, con este comando y volver a actualizar:

~$ sudo apt-key adv --keyserver keys.gnupg.net --recv-key 381BA480

 

FUENTES: